在上一季中解散了“别动搜查队”的“刑警总务课”课长片桐正敏(吉田钢太郎饰)成为室长,带领专职负责案件高发的东京临海地区的“最强别动队”=“第11方面本部准备室”他再次召集了曾是“警视厅搜查一课12系”时期下属的天树(东山纪之饰)、是12系所属的沙村康介(高岛政宏饰)、水田环(仓科加奈饰)、青山新(冢本高史饰)、隶属“未来犯罪预测中心”的山下巧(片冈爱之助饰)、法医学教室教授·堂本俊太郎(北大路欣也饰)等人,与之一起投身与“全季最强敌人”的激烈战斗中去。伴随面向2020年进行重新开发计划所带来的利益斗争激化,临海地区日渐成为新的犯罪温床。这片被誉为现代日本缩影的混乱地带,天树小组将在每集中挑战日趋复杂化、多样化并且国际化的“超凶恶犯罪”。在此过程中,号称临海地区的幕后黑手也开始浮出水面。